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芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

刘国红 林营志 刘波 林乃铨

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芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

    通讯作者: 刘波(1957-),男,博士,研究员,主要从事生物技术及农业生物药物研究(E-mail:liubofaas@163.com); 林乃铨(1948-),男,博士,教授,主要从事害虫综合治理、生物防治和寄生蜂分类(E-mail:green48@163.com); 刘波(1957-),男,博士,研究员,主要从事生物技术及农业生物药物研究(E-mail:liubofaas@163.com); 林乃铨(1948-),男,博士,教授,主要从事害虫综合治理、生物防治和寄生蜂分类(E-mail:green48@163.com)
  • 基金项目:

    国家948项目子专题(2011-G25);福建省科技计划项目省属公益类科研院所基本科研专项(2009R10037-1)

  • 中图分类号: S 476

Comparison of Bacillus Species Identification Based on ITS and Fatty Acid Analysis

  • 摘要: 基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究,与分子鉴定结果相比,脂肪酸种的鉴定准确率可达到99%以上。通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析,结果表明,脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究,根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确聚在一起,而ITS则不能。芽胞杆菌特征性脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO,但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同。对芽胞杆菌3大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例(15:0ISO/15:0ANTEISO)进行了分析,其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群,蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15:0ISO,其次为13:0ISO,而15:0ANTEISO的含量很低,而且不是主要类型,15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为5.6~7.9。简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO,15:0ISO/15:0ANTEISO比值约为1/6。巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15:0ISO和15:0ANTEISO含量相近,其余脂肪酸远远低于这2种主要脂肪酸。巨大芽胞杆菌的15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为4/5~5/4,菌株FJAT-4500为短小芽胞杆菌,其15:0ISO/15:0 ANTEISO比值约为2。短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌归为一类是因为其脂肪酸类型相近,但含量并不同。枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15:0ISO的含量小于15:0ANTEISO,15:0ISO/15:0ANTEISO的比值为1/3~2/3。
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出版历程
    收稿日期: 
  • 初稿:  2011-11-17
  • 修改稿:  2012-02-07

芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

    通讯作者: 刘波, liubofaas@163.com
    通讯作者: 林乃铨, liubofaas@163.com
  • 1. 福建农林大学, 福建 福州 350002;
  • 2. 福建省农业科学院, 福建 福州 350003
基金项目:  国家948项目子专题(2011-G25);福建省科技计划项目省属公益类科研院所基本科研专项(2009R10037-1)

摘要: 基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究,与分子鉴定结果相比,脂肪酸种的鉴定准确率可达到99%以上。通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析,结果表明,脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究,根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确聚在一起,而ITS则不能。芽胞杆菌特征性脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO,但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同。对芽胞杆菌3大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例(15:0ISO/15:0ANTEISO)进行了分析,其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群,蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15:0ISO,其次为13:0ISO,而15:0ANTEISO的含量很低,而且不是主要类型,15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为5.6~7.9。简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO,15:0ISO/15:0ANTEISO比值约为1/6。巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15:0ISO和15:0ANTEISO含量相近,其余脂肪酸远远低于这2种主要脂肪酸。巨大芽胞杆菌的15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为4/5~5/4,菌株FJAT-4500为短小芽胞杆菌,其15:0ISO/15:0 ANTEISO比值约为2。短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌归为一类是因为其脂肪酸类型相近,但含量并不同。枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15:0ISO的含量小于15:0ANTEISO,15:0ISO/15:0ANTEISO的比值为1/3~2/3。

English Abstract

参考文献 (35)

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