• 中文核心期刊
  • CSCD来源期刊
  • 中国科技核心期刊
  • CA、CABI、ZR收录期刊

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

刘国红 林营志 刘波 林乃铨

刘国红, 林营志, 刘波, 林乃铨. 芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较[J]. 福建农业学报, 2012, 27(2): 173-180.
引用本文: 刘国红, 林营志, 刘波, 林乃铨. 芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较[J]. 福建农业学报, 2012, 27(2): 173-180.
LIU Guo-hong, LIN Ying-zhi, LIU Bo, LIN Nai-quan. Comparison of Bacillus Species Identification Based on ITS and Fatty Acid Analysis[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2012, 27(2): 173-180.
Citation: LIU Guo-hong, LIN Ying-zhi, LIU Bo, LIN Nai-quan. Comparison of Bacillus Species Identification Based on ITS and Fatty Acid Analysis[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2012, 27(2): 173-180.

芽胞杆菌种类脂肪酸鉴定与分子鉴定方法的比较

基金项目: 

国家948项目子专题(2011-G25);福建省科技计划项目省属公益类科研院所基本科研专项(2009R10037-1)

详细信息
    通讯作者:

    刘波(1957-),男,博士,研究员,主要从事生物技术及农业生物药物研究(E-mail:liubofaas@163.com); 林乃铨(1948-),男,博士,教授,主要从事害虫综合治理、生物防治和寄生蜂分类(E-mail:green48@163.com)

    刘波(1957-),男,博士,研究员,主要从事生物技术及农业生物药物研究(E-mail:liubofaas@163.com); 林乃铨(1948-),男,博士,教授,主要从事害虫综合治理、生物防治和寄生蜂分类(E-mail:green48@163.com)

  • 中图分类号: S 476

Comparison of Bacillus Species Identification Based on ITS and Fatty Acid Analysis

  • 摘要: 基于ITS序列和脂肪酸鉴定方法对从土壤中分离得到的16株芽胞杆菌进行分类研究,与分子鉴定结果相比,脂肪酸种的鉴定准确率可达到99%以上。通过生物软件SPSS和Mega分别对16株菌进行聚类分析,结果表明,脂肪酸比ITS更适合于芽胞杆菌的分类研究,根据脂肪酸成分可以将16株芽胞杆菌准确聚在一起,而ITS则不能。芽胞杆菌特征性脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO,但不同种芽胞杆菌的此类脂肪酸含量不同。对芽胞杆菌3大类菌群主要特征性脂肪酸的含量比例(15:0ISO/15:0ANTEISO)进行了分析,其中比较特殊的为蜡状芽胞杆菌类群,蜡状芽胞杆菌主要脂肪酸为15:0ISO,其次为13:0ISO,而15:0ANTEISO的含量很低,而且不是主要类型,15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为5.6~7.9。简单芽胞杆菌群主要脂肪酸为15:0ANTEISO和15:0ISO,15:0ISO/15:0ANTEISO比值约为1/6。巨大芽胞杆菌类群主要脂肪酸15:0ISO和15:0ANTEISO含量相近,其余脂肪酸远远低于这2种主要脂肪酸。巨大芽胞杆菌的15:0ISO/15:0ANTEISO的比值约为4/5~5/4,菌株FJAT-4500为短小芽胞杆菌,其15:0ISO/15:0 ANTEISO比值约为2。短小芽胞杆菌和巨大芽胞杆菌归为一类是因为其脂肪酸类型相近,但含量并不同。枯草芽胞杆菌群主要脂肪酸15:0ISO的含量小于15:0ANTEISO,15:0ISO/15:0ANTEISO的比值为1/3~2/3。
  • [1] PRIEST F G, GOODFELLOW M, TODD C. A numerical classification of the genus Bacillus[J]. J Gen Microbiol, 1988, 134:1847-1882.
    [2]
    [3] Sherlock Microbial Identification System, Version 6.0, MIS Operating Mannual[M]. Newark, DE:MIDI, Inc., 2002.
    [4] TAMURA K, DUKLEY J, NDI M,et al.MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0[J]. Molecular Biology and Evolution, 2007, 24, 1596-1599.
    [5] TAMURA K, NEI M,KUMAR S.Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method[J].Proceedings of the National Academy of Sciences (USA), 2004, 101:11030-11035.
    [6]
    [7] 辛玉华, 东秀珠, 吴明强. ITS序列同源性在苏云金芽孢杆菌分型中的应用研究[J]. 微生物学通报, 2000, 27(3):178-181.
  • 加载中
计量
  • 文章访问数:  3117
  • HTML全文浏览量:  88
  • PDF下载量:  450
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2011-11-17
  • 修回日期:  2012-02-07
  • 刊出日期:  2012-02-29

目录

    /

    返回文章
    返回