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短短芽胞杆菌代谢物组测定中代谢终止方式的优化

陈梅春 刘波 朱育菁 陈峥 史怀 刘国红 潘志针

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短短芽胞杆菌代谢物组测定中代谢终止方式的优化

    通讯作者: 刘波(1957-),博士,男,研究员,主要从事微生物生物技术与农业生物药物研究(E-mail:fzliubo@163.com)
  • 基金项目:

    国家重点基础研究发展计划("973"计划)前期项目(2011CB111607);国家"948"项目(2011-G25);福建省农业科学院青年科技创新基金(2012DBS-1);福建省青年科技人才创新基金项目(2011J05053)

  • 中图分类号: S476.1

Metabolomic Quenching for Brevibacillus brevis

  • 摘要: 微生物代谢组学是定性和定量研究分析细胞内外所有低分子量代谢产物,在发酵控制分析、代谢物控制分析及其他组学联用进行菌种改良等方面得到了应用。胞内代谢物种类和浓度变化非常迅速,因此快速冻结代谢反应是非常重要的,所以必须有效率高和可靠的代谢终止方式,减少代谢物的流失。本研究以短短芽胞杆菌JK-2为研究对象,以LC-MS测定为评价标准,考察了5种代谢终止方式对胞内代谢物保留程度。结果表明,冷甲醇/水(含HEPES)代谢终止方式能够保留的代谢物最多,效率最高及其重现性好,在LC-MS正离子模式下,能够提取出3 000多种胞内代谢物。同时也考察了样品在正负模式下测试情况,结果表明正离子模式下能够检测到的代谢物的数目远远超过负离子模式下检测的数目。
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出版历程
    收稿日期: 
  • 初稿:  2012-10-24
  • 修改稿:  2012-12-12

短短芽胞杆菌代谢物组测定中代谢终止方式的优化

    通讯作者: 刘波, fzliubo@163.com
  • 1. 福建省农业科学院农业生物资源研究所,福建 福州 350003
基金项目:  国家重点基础研究发展计划("973"计划)前期项目(2011CB111607);国家"948"项目(2011-G25);福建省农业科学院青年科技创新基金(2012DBS-1);福建省青年科技人才创新基金项目(2011J05053)

摘要: 微生物代谢组学是定性和定量研究分析细胞内外所有低分子量代谢产物,在发酵控制分析、代谢物控制分析及其他组学联用进行菌种改良等方面得到了应用。胞内代谢物种类和浓度变化非常迅速,因此快速冻结代谢反应是非常重要的,所以必须有效率高和可靠的代谢终止方式,减少代谢物的流失。本研究以短短芽胞杆菌JK-2为研究对象,以LC-MS测定为评价标准,考察了5种代谢终止方式对胞内代谢物保留程度。结果表明,冷甲醇/水(含HEPES)代谢终止方式能够保留的代谢物最多,效率最高及其重现性好,在LC-MS正离子模式下,能够提取出3 000多种胞内代谢物。同时也考察了样品在正负模式下测试情况,结果表明正离子模式下能够检测到的代谢物的数目远远超过负离子模式下检测的数目。

English Abstract

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