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红掌遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析

户帅雅 李斌奇 陈孝丑 巫伟峰 张毅智 陈春 陈发兴

户帅雅,李斌奇,陈孝丑,等. 红掌遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析 [J]. 福建农业学报,2020,35(1):20−27 doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.01.004
引用本文: 户帅雅,李斌奇,陈孝丑,等. 红掌遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析 [J]. 福建农业学报,2020,35(1):20−27 doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.01.004
HU S Y, LI B Q, CHEN X C, et al. ISSR Analysis on Genetic Diversity and Relationships among Anthurium andraeanum [J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences,2020,35(1):20−27 doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.01.004
Citation: HU S Y, LI B Q, CHEN X C, et al. ISSR Analysis on Genetic Diversity and Relationships among Anthurium andraeanum [J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences,2020,35(1):20−27 doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.01.004

红掌遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.01.004
基金项目: 福建省林业厅项目(闽林科[2015]2号)
详细信息
    作者简介:

    户帅雅(1995−),男,硕士研究生,研究方向:花卉与观赏园艺(E-mail:1959720480@qq.com

    通讯作者:

    陈发兴(1967−),男,研究员,博士生导师,研究方向:园艺植物生理与分子生物学(Emai:cfaxing@126.com

  • 中图分类号: S 682.39

ISSR Analysis on Genetic Diversity and Relationships among Anthurium andraeanum

  • 摘要:   目的  通过ISSR分子标记技术对56个红掌品种进行遗传多样性及亲缘关系分析,为红掌新品种选育、品种改良、种质资源管理等研究提供参考依据。  方法  以采集到的56个红掌品种为试验材料,从100条哥伦比亚大学(UBC)公布的ISSR (inter-simple sequence repeat简单重复序列) 分子标记引物中筛选出10条多态性引物,利用筛选得到的10个通用引物,构建红掌ISSR分子标记技术体系;对PCR扩增结果进行UPGMA(Unweighted pair-group method arithmetic average 非加权成组算术平均数)聚类分析,并计算其Nei’s基因多样性指数和Shannon’s信息指数。  结果  结果显示,从100条ISSR引物中筛选出10条多态性引物,共扩增得到99个基因位点,其中多态性位点95个,多态性比率为95.96%。用POPGENE分析结果得:Nei’s基因多样性指数(H)为0.303 6;Shannon’s信息指数(I)为0.458 5。聚类分析结果表明56个红掌品种可以分为12类;  结论  分类结果与火焰苞颜色存在一定的相关性,ISSR分子标记技术可以很好地应用于红掌品种及其亲缘关系的鉴定,罗兰公主、香妃、索米、彩霞、紫雷鸟、黑皇后、国王等7个品种性状独特,且相互之间遗传距离较远,可以作为新品种选育、品种改良的母本,也可以作为优良的种质资源进行保存。
  • 图  1  DNA提取电泳结果

    注:M:标准分子量marker 2 000;

    Figure  1.  DNA extraction electropherogram

    Note:M:DL2 000 DNA marker

    图  2  UBC872-UBC894引物筛选电泳结果

    注:M: 标准分子量marker 2 000;1:UBC807、2:UBC810、3:UBC811、4:UBC817、5:UBC825、6:UBC836、7:UBC840、8:UBC843、9:UBC850、10:UBC854

    Figure  2.  UBC872-UBC894 primer screening electropherogram

    Note:M:DL2 000 DNA marker; 1:UBC807、2:UBC810、3:UBC811、4:UBC817、 5:UBC825、6:UBC836、7:UBC840、8:UBC843、9:UBC850、10:UBC854.

    图  3  UBC850对56种红掌品种的ISSR扩增结果

    注:M: 标准分子量marker 2 000;1~56:56个红掌品种见表1。

    Figure  3.  ISSR amplification map of 56 species of Anthurium varieties by UBC850

    Note:M:DL2 000 DNA marker; 1~56:56 anthurium varieties are shown in Table 1.

    图  4  56个红掌品种扩增结果聚类分析

    Figure  4.  Clustering analysis on 56 Anthurium varieties based on amplification results

    表  1  红掌品种名目

    Table  1.   List of Anthurium varieties

    序号
    Serial number
    品种名(代号)
    Variety name(Code)
    花色
    Color
    来源
    Source
    序号
    Serial number
    品种名(代号)
    Variety name(Code)
    花色
    Color
    来源
    Source
    1 大哥大
    Dakota
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    22 潘多拉
    Pandola
    粉 Pink 安祖园艺有限公司
    Anthura
    2 阿拉巴马
    Alabama
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    23 夏之恋
    Summer Love
    粉+绿
    Pink+Green
    瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    3 粉冠军
    Pink Champion
    粉 Pink 安祖园艺有限公司
    Anthura
    24 红国王
    Red King
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    4 维他
    Vita
    红 Red 广州市花卉科学研究所
    Guangzhou Institute of Flower Science
    25 第一红
    First Red
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    5 广州红
    Guangzhou Red
    红 Red 广州市花卉科学研究所
    Guangzhou Institute of Flower Science
    26 迷你红
    Nano Red
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    6 旭日
    Rising sun
    粉 Pink 广州市花卉科学研究
    Institute of Flower Science
    27 红宝贝
    Red Baby
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    7 朝霞
    Asaka
    红 Red 广州市花卉科学研究所
    Guangzhou Institute of Flower Science
    28 甜冠军
    Sweet Champion
    粉 Pink 安祖园艺有限公司
    Anthura
    8 彩霞
    pink clouds
    粉 Pink 广州市花卉科学研究所
    Guangzhou Institute of Flower Science
    29 红唇
    Princess Amalia Elegance
    红+白
    Red + White
    瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    9 热情
    Tropical
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    30 梦幻
    Fantasy Love
    白+绿
    White + Green
    瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    10 皇冠
    royal crown
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    31 白马王子
    Prince Charming
    白 white 三明市农科院花卉所
    Sanming Agricultural Science Research Institute
    11 阿瑞博
    Arebo
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    32 Adios pink 粉 Pink 三明市农科院花卉所
    Sanming Agricultural Science Research Institute
    12 维多
    Vito
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    33 粉爱
    Pink Love
    粉 Pink 安祖园艺有限公司
    Anthura
    13 香妃
    Fiorino
    紫 purple 安祖园艺有限公司
    Anthura
    34 布加迪威龙
    Bugatti Veyron
    红 Red 广州市花卉科学研究所
    Guangzhou Institute of Flower Science
    14 索米
    Sumi
    白 white 安祖园艺有限公司
    Anthura
    35 罗兰公主
    Princess Alexia Violet
    白 white 安祖园艺有限公司
    Anthura
    15 国王
    Arrow
    墨绿
    Dark green
    安祖园艺有限公司
    Anthura
    36 紫雷鸟
    Thunderbird Luxury
    紫 purple 安祖园艺有限公司
    Anthura
    16 白冠军
    White Champion
    白 white 安祖园艺有限公司
    Anthura
    37 洋葱 VR990 紫 purple 安祖园艺有限公司
    Anthura
    17 阿瓦托
    Avento
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    38 唇彩
    Lipstick Red
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    18 特伦萨
    Turenza
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    39 红布加迪
    Bugatti Red
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    19 特仙
    Special fairy
    红 Red 广州市花卉科学研究所
    Guangzhou Institute of Flower Science
    40 黑皇后
    Black Queen
    黑 black 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    20 马都拉
    Madural
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    41 红成功
    Red Success
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    21 红赢家
    Red Winner
    红 Red 安祖园艺有限公司 Anthura 42 橙布加迪
    Bugatti Royal
    橙 Orange 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    43 绿国王
    Greed King
    绿 green 安祖园艺有限公司
    Anthura
    50 马蒂兹
    Matiz
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    44 满天星
    Gypsophila
    红 Red 三明市农科院花卉所
    Sanming Agricultural Science Research Institute
    51 彩虹冠军
    Rainbow champion
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    45 莱尼 Lenny 红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    52 白骄阳
    White Sierra
    白 White 三明市农科院花卉所
    Sanming Agricultural Science Research Institute
    46 阿美拉
    Amera
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    53 甜梦
    Sweet Dreams
    红 Red 三明市农科院花卉所
    Sanming Agricultural Science Research Institute
    47 红班比诺
    Red bandino
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    54 白鸽
    White pigeon
    白 White 福建省林业科技试验中心
    Forestry Science and Technology Test Center of Fujian Province
    48 轰动
    Sensation
    红 Red 安祖园艺有限公司
    Anthura
    55 红衣少女
    Red girl
    红 Red 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    49 朱莉
    Julie
    粉 Pink 瑞恩花卉有限公司
    Ryan
    56 新星
    New star
    红 Red 福建省林业科技试验中心
    Forestry Science and Technology Test Center of Fujian Province
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出版历程
  • 收稿日期:  2019-08-08
  • 修回日期:  2019-10-27
  • 刊出日期:  2020-01-01

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