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杨梅endo-PG基因单核苷酸多态性(SNP)分析

焦云 舒巧云 刘珠琴

焦云, 舒巧云, 刘珠琴. 杨梅endo-PG基因单核苷酸多态性(SNP)分析[J]. 福建农业学报, 2016, 31(5): 465-470. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.05.005
引用本文: 焦云, 舒巧云, 刘珠琴. 杨梅endo-PG基因单核苷酸多态性(SNP)分析[J]. 福建农业学报, 2016, 31(5): 465-470. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.05.005
JIAO Yun, SHU Qiao-yun, LIU Zhu-qin. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Analysis of the Endopolygalacturonase Gene in Chinese Bayberry (Myrica rubra)[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2016, 31(5): 465-470. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.05.005
Citation: JIAO Yun, SHU Qiao-yun, LIU Zhu-qin. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Analysis of the Endopolygalacturonase Gene in Chinese Bayberry (Myrica rubra)[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2016, 31(5): 465-470. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.05.005

杨梅endo-PG基因单核苷酸多态性(SNP)分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2016.05.005
基金项目: 

宁波市农业科学研究院院长基金项目(2015NKYP001)

详细信息
    作者简介:

    焦云(1983-),男,副研究员,博士,研究方向:果树遗传育种与栽培技术(E-mail:jydyx@163.com)

  • 中图分类号: S667

Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Analysis of the Endopolygalacturonase Gene in Chinese Bayberry (Myrica rubra)

  • 摘要: Endo-PG基因在果实肉质变化以及后熟软化过程中发挥重要作用。采用PCR直接测序法对45份杨梅试材中endo-PG基因的部分DNA序列进行单核苷酸多态性分析,测序总长度为1866 bp,共发现178个SNP,其中,单现突变位点为60个,简约信息位点为118个,核苷酸多态性值(Pi)为0.27。通过单倍型分析发现在45份杨梅试材中的endo-PG基因存在12种单倍型。基于邻接法NJ构建endo-PG基因系统进化树,结果表明45份杨梅试材被划分为4个组,聚类结果与果实硬度存在一定联系;此外,荸荠等品种存在2种等位基因,且两者差异较大,被划分于不同分组;而东魁等品种纯合度相对较高。
  • [1] LI X,JIANG J,ZHANG L,et al. Identification of volatile and softening-related genes using digital gene expression profiles in melting peach[J]. Tree Genet Genomes,2015,11(4):1-15.
    [2] ARANZANA M J,ILLA E,HOWAD W,et al. A first insight into peach[Prunus persica (L.) Batsch]SNP variability[J]. Tree Genet Genomes,2012,8(6):1359-1369.
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出版历程
  • 收稿日期:  2015-11-19
  • 修回日期:  2016-01-13
  • 刊出日期:  2016-05-28

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