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基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育

吴宇芬 周先治 陈晟 陈阳 赵依杰

吴宇芬, 周先治, 陈晟, 陈阳, 赵依杰. 基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育[J]. 福建农业学报, 2010, 25(2): 170-175.
引用本文: 吴宇芬, 周先治, 陈晟, 陈阳, 赵依杰. 基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育[J]. 福建农业学报, 2010, 25(2): 170-175.
WU Yu-fen, ZHOU Xian-zhi, CHEN Sheng, CHEN Yang, ZHAO Yi-jie. Phylogeny of Cucurbita Based on ITS sequence data[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2010, 25(2): 170-175.
Citation: WU Yu-fen, ZHOU Xian-zhi, CHEN Sheng, CHEN Yang, ZHAO Yi-jie. Phylogeny of Cucurbita Based on ITS sequence data[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2010, 25(2): 170-175.

基于ITS序列探讨南瓜属植物系统发育

基金项目: 

福建省科技计划重点项目(2007I0037);福建省自然科学基金项目(2009J01069)

详细信息
    通讯作者:

    周先治(1976- ),男,助理研究员,博士,主要从事生物资源研究(E-mail:xianzhizhou@126.com)

  • 中图分类号: S642

Phylogeny of Cucurbita Based on ITS sequence data

  • 摘要: 基于ITS序列对南瓜属3个种(中国南瓜、美洲南瓜和黑籽南瓜)的系统发育进行了研究。结果表明,ITS1全长188~191bp,ITS2全长251~263bp;南瓜ITS1序列的变异位点数为33,占ITS1全序列的17.55%,ITS1序列的信息位点数为24,占ITS1全序列的12.77%;南瓜ITS2序列的变异位点数为45个,占ITS2全序列的17.93%,ITS2的信息位点数为31个,占ITS2全序列的12.35%;ITS1的G+C含量变化范围为51.60%~54.50%,ITS2的G+C含量变化范围为53.78%~56.98%;基于ITS1和ITS2分别构建的系统树可以看出,中国南瓜和美洲南瓜的亲缘关系较近,与黑籽南瓜的亲缘关系较远。
  • [1] 赵福宽,李海英,赵晓萌.南瓜种质资源亲缘关系的RAPD分析[J].分子植物育种,2006,4 (3):45-50.
    [2] 张天明,屈东玉,王长林,等.南瓜属4个栽培种亲缘关系的AFLP分析[J].中国蔬菜,2006(1):11-14.
    [3] HSIAO C,CHATTERTON N J,ASAY K H,et al.Phylogenetic relationships of the monogenomic species of the wheat tribe,Triticeae(Poaceae),inferred from nuclear rDNA (internal transcribed spacer) sequences[J].Genome,1995,38 (2):211-223.
    [4] 戴小军,梁满中,陈良碧.栽培稻种内核糖体基因的ITS序列比较研究[J].作物学报,2007,33 (11):1874-1878.
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出版历程
  • 收稿日期:  2010-01-05
  • 修回日期:  2010-04-01
  • 刊出日期:  2010-04-15

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