长果种黄麻DNA的提取及SRAP分子标记体系的建立

陈晖; 陈美霞; 陈艳萍; 危成林; 廖英明; 陈富成; 陶爱芬; 徐建堂; 祁建民

长果种黄麻DNA的提取及SRAP分子标记体系的建立

1.
福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室,福建福州 350002;
2.
福建省东山出入境检验检疫局,福建漳州 363401;
3.
宁德师范学院生物工程系,福建宁德 352100;
4.
福建省农业科学院,福建福州 350003

基金项目:

国家自然科学基金项目(30571188)

详细信息

作者简介:
陈晖(1984-),女,硕士,研究方向:黄麻生化与分子生物学研究; 陈美霞(1983-),女,博士研究生,研究方向:麻类生化与分子生物学研究

陈晖(1984-),女,硕士,研究方向:黄麻生化与分子生物学研究; 陈美霞(1983-),女,博士研究生,研究方向:麻类生化与分子生物学研究

通讯作者:
祁建民(1948-),男,教授,博士生导师,研究方向:作物遗传育种研究、生化与分子生物学研究(E-mail:Qijm863@163.com)

中图分类号: S 563.4
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出版历程
- 收稿日期: 2011-06-26
- 修回日期: 2011-07-20
- 刊出日期: 2011-10-15

Extraction of Genomic DNA from Corohorus olitorius L. and Establishment of SRAP Reaction System

1.
Key Laboratory of Ministry of Education for Genetics, Breeding and Multiple Utilization of Crops, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China;
2.
Dongshan Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Zhangzhou, Fujian 363401, China;
3.
Ningde Normal University Biological Engineering, Ningde, Fujian 352100, China;
4.
Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, Fujian 350003, China

摘要

摘要: 以宽叶长果和甜麻杂交产生的F2代为材料,研究长果种黄麻DNA的提取方法和SRAP分子标记技术中的主要影响因素(包括模板DNA浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶浓度、dNTPs浓度及上下游引物浓度)。最终建立了适于长果种黄麻DNA提取的CTAB法与SRAP-PCR反应体系(25 L): 模板DNA 100 ng,引物浓度0.48 molL-1,Mg2+浓度2.8 mmolL-1,dNTPs浓度0.35 mmolL-1,Taq DNA聚合酶0.7 U。
- 长果种黄麻 /
- DNA提取 /
- SRAP /
- 反应体系优化
Abstract: In this study, extract high quality genomic DNA from jute (Corohorus olitorius L) and establish a stable SRAP reaction system, including template DNA concentration, Mg2+ concentration, Taq DNA polymerase concentration, dNTPs concentration and forward and reverse primer concentration, using a population F2 progeny derived from a cross of glycanes thesia (wild species) and wild leaf jute (cultivated species). The results showed that the DNA isolated with modified CTAB method had good quality. The optimum SRAP reaction system could amplify high levels of polymorphism, good repeatability and clear band pattern. SRAP-PCR system (total volume of 25 l) was established as follows: template DNA 100 ng, forward primer 0.48 molL-1, reverse primer 0.48 molL-1, Mg2+ 2.8 mmolL-1, dNTPs 0.35 mmolL-1, Taq DNA polymerase 0.7 U. It showed that the optimized system can be applied in the SRAP analysis for Corohorus olitorius L., which provided technical support for the genetic linkage map construction in the future.
- Jute (Corohorus olitorius L.) /
- DNA extraction /
- sequence-related amplified polymorphism (SRAP) /
- optimization reaction system

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参考文献(5)

[1]
[2]	徐建堂,祁建民,方平平,等. CTAB法提取红麻总DNA技术优化与ISSR和SRAP扩增效果 [J]. 中国麻业科学,2007,29(4):179-183.
[3]	LIN Z X, ZHANG X L, NIE Y C, et al. Construction of a genetic linkage map for cotton based on SRAP [J]. Chinese Science Bulletin,2003, 48(19): 2063-2067.
[4]
[5]