应用表型系统聚类和SSR分子标记研究水稻亲本及籼粳衍生系遗传多样性

杨旺兴; 许旭明; 祁建民; 卓伟; 张受刚; 马彬林; 韦新宇; 邹文广

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2013.03.004

应用表型系统聚类和SSR分子标记研究水稻亲本及籼粳衍生系遗传多样性

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2013.03.004

1. 福建省三明市农业科学研究院/国家水稻产业体系三明综合试验站,福建沙县,365509;
2. 福建农林大学生命科学院,福建福州,350002

基金项目:

国家科技支撑计划子课题(2006BAD01A01-3)

福建省科技计划项目(2007N0070)

详细信息

作者简介:
杨旺兴(1979-),男,硕士,助理研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:yyy99425@163.com);许旭明(1964-),男,研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:fj63xxm@sina.com);祁建民(1948-),男,教授,博士生导师,主要从事作物遗传育种研究

中图分类号: S511
计量
- 文章访问数: 116
- HTML全文浏览量: 13
- PDF下载量: 0
- 被引次数: 0
出版历程
- 收稿日期: 2013-01-18
- 刊出日期: 2013-03-18

Genetic Diversity of Parents and Derived Lines Based on Phenotypic Characters and SSR Cluster Analysis

1. Sanming Academy of Agricultural Sciences,Sanming Integrated Test Station of National Rice Industrial Technology System,Shaxian,Fujian 365509,China;
2. College of Life Sciences,Fujian Agriculture & Forestry University,Fuzhou,Fujian 350002,China

摘要

摘要: 以17份籼稻、粳稻亲本及39份籼粳亚种间杂交衍生系为材料,利用SSR分子标记和表型系统聚类进行类群划分和遗传多样性分析。类群结果表明:分子标记聚类与表型聚类结果较吻合,均能较准确地将优势类群聚在一起。表型聚类不能准确反映供试材料之间的亲缘关系,而分子标记聚类可以从分子水平上反映各品种间的差异,并能较准确地反映供试材料间的亲缘关系,说明SSR分子聚类适用于亲缘关系不明晰材料的亲缘分析及优势类群划分。以221对SSR引物对试验材料进行遗传多样性分析,结果表明籼粳交衍生系的多样性Nei指数、多样性Shannon指数、PIC多态指数最大值均大于亲本,Nei基因多样性指数最大值为0.819,亲本为0.796;Shannon多样性指数最大值为1.856,亲本为1.677;多态信息含量(PIC)最大值为0.796,亲本为0.766;表明已经选育出的部分籼粳亚种间杂交衍生系有着比供试亲本更丰富的等位基因变异。
- 水稻 /
- 籼粳杂交 /
- 衍生系 /
- 微卫星标记 /
- 遗传多样性
Abstract: Using 39 Minghui derived lines from indica-japonica cross and 17 indica and japonica parents as materials,the heterotic grouping and the genetic diversity analysis were researched.The result of the cluster analysis with SSR molecular markers was similar to it of the cluster analysis with phenotype on accurately clustering dominant groups.However,the cluster analysis with phenotypic traits did not accurately indicate the relationship between tested materials but SSR markers did it at the molecular level.It suggests that the cluster analysis of SSR molecular markers could be applied to unknown materials in relationship for the heterotic grouping.SSR markers of 221 primer pairs were used to analyze genetic diversity of tested materials.The results showed that,the maximum values of Nei gene diversity index,Shannon diversity index and polymorphism information content(PIC) were all higher in the strains of indica-japonica cross than in parental values.The maximum value of Nei gene diversity index,Shannon diversity index,polymorphism information content(PIC) were 0.819,1.856,0.796 for the strains of indica-japonica cross,respectively,and 0.796,1.677,0.766 for their parents′respectively.It indicated that,by genetic selection,the allelic variation was more abundant in the strains of indica-japonica cross than in the parental.
- Rice /
- Hybrids between Indica and Japonica /
- Derived Lines /
- SSR /
- Genetic Diversity

HTML全文

参考文献(35)

[1]	袁隆平.杂交水稻超高产育种[J].杂交水稻,1997,12(6):1-6.
[2]	程式华,廖西元,闵绍楷.中国超级稻研究:背景、目标和有关问题的思考[J].中国稻米,1998,(1):3-5.
[3]	陈能刚,阮仁超,陈惠查,等.香稻种质资源主要农艺性状的聚类与评价[J].贵州农业科学,2008,36(6):1-3.
[4]	陈绍栋.籼稻穗部性状遗传距离的聚类分析及穗型判别分析[J].福建农业科技,2002,(4):1-3.
[5]	殷延勃,马洪文.宁夏水稻品种农艺性状分析及聚类分析[J].种子,2008,27(10):72-74.
[6]	樊叶杨,庄杰云,吴建利,等.应用微卫星标记鉴别水稻籼粳亚种[J].遗传,2000,22(6):392-394.
[7]	苏顺宗,黄玉碧,杨俊品,等.利用SSR鉴定水稻杂交种子纯度的研究[J].种子,2003,(1):23-35.
[8]	詹庆才.利用微卫星DNA标记进行杂交水稻种子纯度鉴定的研究[J].杂交水稻,2002,17(5):46-50.
[9]	彭锁堂,庄杰云,颜启传,等.我国主要杂交水稻组合及其亲本SSR标记和纯度鉴定[J].中国水稻科学,2003,17(1):1-5.
[10]	程本义,夏俊辉,沈伟峰,等.微卫星标记分析我国南方常规水稻品种的遗传差异[J].核农学报,2009,23(1):7-10.
[11]	朱作峰,孙传清,李自超,等.用SSR标记对水稻品种的分类研究[J].农业生物技术学报,2001,9(1):58-61.
[12]	毛艇,徐海,郭艳华,等.利用SSR分子标记进行水稻籼粳分类体系的初步构建[J].华北农学报,2009,24(1):119-124.
[13]	应杰政,施勇烽,庄杰云,等.用微卫星标记评估中国水稻主栽品种的遗传多样性应[J].中国农业科学,2007,40(4):649-654.
[14]	宣云,赵伟,宋丰顺,等.利用SSR标记分析部分粳稻品种的遗传多样性[J].核农学报,2007,21(3):217-220.
[15]	刘炜,李自超,史延丽,等.利用SSR标记进行粳稻品种的遗传多样性研究[J].西南农业学报,2005,18(5):509-513.
[16]	许旭明.水稻籼粳亚种间杂交籼粳衍生系遗传基础的研究[D].福州:福建农林大学,2009.
[17]	孙亚东,梁燕,吴江敏,等.番茄种质资源的遗传多样性和聚类分析[J].西北农业学报,2009,18(5):297-301.
[18]	吴明基,向海涛,刘华清,等.利用形态学性状及SSR分子标记鉴定水稻优良恢复系闽恢3301的亲代来源[J].福建农业学报,2012,27(7):673-678.
[19]	朱勋,杨家强,吴青君,等.小菜蛾不同地理种群遗传多样性的ISSR标记研究[J].昆虫学报,2012,55(8):981-987.
[20]	BOSTSEIN D,WHITE R L,SKOLNICK M D W.Construction of a genetic linkage map in man using restrictionfragment polymorphisms[J].American Journal of HumanGenetics,1980,32:314-331.
[21]	张桂权,卢永根.水稻粳型亲籼系的创建及其在超级稻育种上的利用[J].沈阳农业大学学报,2007,38(5):676-680.
[22]	杨守仁,张龙步,徐正进,等.水稻理想株形育种的基础研究及其与国内外同类研究的比较[J].中国水稻科学,1993,7(3):187-192.
[23]	徐正进,陈温福,张文忠,等.北方粳稻新株型超高产育种研究进展[J].中国农业科学,2004,37(10):1407-1413.
[24]	马均,周开达.亚种间重穗型杂交稻穗颈维管束与穗部性状的关系[J].西南农业学报,2001,14(3):1-5.
[25]	袁隆平,武小金,颜应成,等.水稻广谱广亲和系的选育策略[J].中国农业科学,1997,30(4):1-8.
[26]	张兆兰,王才林.利用粳型广亲和恢复系与籼稻不育系配制亚种问杂种[J].江苏农业学报,1990,(6):161-167.
[27]	许旭明,张受刚,卓伟,等.水稻广亲和恢复系GK729的表现及其利用[J].福建稻麦科技,1997,15(1):l7-20.
[28]	赵勇,杨凯,AKBAR ALI CHEEMA,等.利用水稻功能基因SSR标记鉴定水稻种质资源[J].中国农业科学,2002,35(4):349-353.
[29]	刘炜,李自超,史延丽,等.利用SSR标记进行粳稻品种的遗传多样性研究[J].西南农业学报,2005,18(5):509-513.
[30]	赵庆勇,朱镇,张亚东,等.SSR标记遗传距离与粳稻杂种优势的相关性分析[J].中国水稻科学,2009,23(2):141-147.
[31]	应杰政,施勇烽,庄杰云,等.用微卫星标记评估中国水稻主栽品种的遗传多样性应[J].中国农业科学,2007,40(4):649-654.
[32]	敖光辉,王丽,魏琴,等.籼粳稻亚种间分子标记差异分析[J].安徽农业科学,2008,36(5):1778-1780.
[33]	何风华,曾瑞珍,席营.不同Waxy基因水稻的遗传多样性[J].分子植物育种,2003,1(2):179-186.
[34]	王胜军,陆作楣,万建民.采用表型和分子标记聚类研究杂交籼稻亲本的遗传多样性[J].中国水稻科学,2006,20(5):475-480.
[35]	耿立格,王丽,娜张磊,等.河北省绿子叶黑豆种质资源表现型和ISSR标记遗传多样性分析[J].植物遗传资源学报,2010,11(3):266-270.

施引文献

资源附件(0)

访问统计

点击查看大图

计量

文章访问数: 116
HTML全文浏览量: 13
PDF下载量: 0
被引次数: 0

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

留言板

应用表型系统聚类和SSR分子标记研究水稻亲本及籼粳衍生系遗传多样性

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2013.03.004

作者简介:
杨旺兴(1979-),男,硕士,助理研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:yyy99425@163.com);许旭明(1964-),男,研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:fj63xxm@sina.com);祁建民(1948-),男,教授,博士生导师,主要从事作物遗传育种研究

计量

Genetic Diversity of Parents and Derived Lines Based on Phenotypic Characters and SSR Cluster Analysis

计量

目录

留言板

应用表型系统聚类和SSR分子标记研究水稻亲本及籼粳衍生系遗传多样性

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2013.03.004

作者简介: 杨旺兴(1979-),男,硕士,助理研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:yyy99425@163.com);许旭明(1964-),男,研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:fj63xxm@sina.com);祁建民(1948-),男,教授,博士生导师,主要从事作物遗传育种研究

计量

出版历程

Genetic Diversity of Parents and Derived Lines Based on Phenotypic Characters and SSR Cluster Analysis

计量

出版历程

目录

作者简介:
杨旺兴(1979-),男,硕士,助理研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:yyy99425@163.com);许旭明(1964-),男,研究员,主要从事水稻遗传育种研究(E-mail:fj63xxm@sina.com);祁建民(1948-),男,教授,博士生导师,主要从事作物遗传育种研究