中国水仙叶绿体ATP合成酶基因NtATPF的克隆与序列分析

林江波; 王伟英; 邹晖; 李海明; 吴水金; 戴艺民

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2014.06.007

中国水仙叶绿体ATP合成酶基因NtATPF的克隆与序列分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2014.06.007

福建省农业科学院甘蔗研究所,福建漳州,363005

基金项目:

福建省农业科学院创新重点项目 (2007YCXZ02)

福建省自然科学基金项目 (2010J01090)

详细信息

作者简介:
林江波 (1976-), 男, 硕士, 副研究员, 主要从事农业生物技术研究戴艺民 (1969-), 男, 博士, 研究员, 主要从事农业生物技术研究 (E-mail:214351704@qq.com);林江波 (1976-), 男, 硕士, 副研究员, 主要从事农业生物技术研究戴艺民 (1969-), 男, 博士, 研究员, 主要从事农业生物技术研究 (E-mail:214351704@qq.com)

中图分类号: S682.21
计量
- 文章访问数: 143
- HTML全文浏览量: 30
- PDF下载量: 0
- 被引次数: 0
出版历程
- 收稿日期: 2014-01-12
- 刊出日期: 2014-06-18

Cloning and Sequence Analysis of Chloroplast ATP Synthase Gene NtATPFfrom Narcissus tazetta var.Chinensis

Sugarcane Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences

摘要

摘要: 以多效唑诱导中国水仙的抑制差减杂交文库 (SSH) 获得的cDNA片段为基础, 采用RACE及RT-PCR技术, 分离克隆到1个ATP合成酶CF0B亚基基因NtATPF。此基因包含有1个555bp完整阅读框架 (ORF) , 编码184个氨基酸, 具有1个跨膜区域 (27⁴9) , 分子量为20.809 5kD, 理论等电点为5.69。聚类分析表明:其氨基酸序列与葱的叶绿体ATP合成酶CF0B亚基蛋白氨基酸序列亲缘关系最近。
- 中国水仙 /
- ATP合成酶 /
- 基因克隆
Abstract: Based on a fragment cDNA from suppression subtractive hybridization (SSH) of Narcissus tazetta var.chinensis induced by paclobutrazol, an ATP Synthase CF0 subunit gene NtATPF was separated and cloned by RACE and RT-PCR.The full length of NtATPFcDNA was 905 bp with a 555 bp ORF, which encoded a protein of184 amino acids and had a transmembrance domain (27-49) with a predicted molecular mass of 20.809 5kD and theoretical isoelectric point of 5.69.Phylogenetic analysis showed that NtATPF had close relationship to ATP Synthase CF0 subunit in Allium fistulosum (AEX93661.1) .
- Narcissus tazetta var.Chinensis /
- ATP synthase /
- gene cloning

HTML全文

参考文献(1)

[1]

徐卫红.ATP合成酶及其功能机制综述[J].上饶师范学院学报, 2004, 24 (3) :36-40, 78.[2]任汇淼, 魏家绵, 沈允钢.叶绿体ATP合成酶的结构、功能及调节的研究进展[J].植物生理学通讯, 1994, 30 (3) :161-169.[3]季云美, 任旭琴.植物生长调节剂在水仙上的应用[J].淮阴工学院学报, 2004, 13 (5) :86-88.[4]王伟英, 邹晖, 戴艺民, 等.多效唑喷雾对中国水仙的矮化效应[J].热带作物学报, 2011, 32 (9) :1661-1664.[5]林江波, 王伟英, 邹晖, 等.中国水仙叶绿素ab结合蛋白基因Ntcab1的克隆与序列分析[J].福建农业学报, 2013, 28 (5) :463-467.[6]邱瑾, 陈平, 钟然, 等.多效唑对水仙生长和光合特性的影响[J].厦门大学学报:自然科学版, 2005, 44 (6) :851-855.[7]熊作明, 周建东, 黄永高, 等.多效唑浸根处理对水仙的矮化效应[J].江苏农业科学, 2006, (6) :251-253.[8]MARCHLER-BAUER A.CDD:a conserved domain databases for the functional annotation of proteins[D].nucleic acids res, 2011, 39:225-229.[9]MARCHLER-BAUER A.CDD:specific functional annotation with the conserved domain database[D].nucleic acids res, 2009, 37:205-210.[10]MARCHLER-BAUER A, BRYANT S H.CD-Search:protein domain annotations on the fly[J].nucleic acids res, 2004, 32:327-331.[11]娄沂春, 董海涛, 李德葆.水稻叶绿体ATP合成酶基因转录丰度受赤霉素诱导调节[J].中国水稻科学, 2001, 15 (1) :17-20.[12]张欣欣, 柳参奎.水稻线粒体ATP合成酶小亚基基因的鉴定及解析[J].分子植物育种, 2003, 1 (5/6) :605-612.[13]关尔鑫, 魏鑫, 李莹, 等.小麦atpC基因植物超量表达载体的构建[J].沈阳师范大学学报:自然科学版, 2011, 29 (2) :297-300.

施引文献

资源附件(0)

访问统计