滇中茶树种质资源亲缘关系的ISSR分析

吴田; 蓝增全; 王华芳

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2017.012.005

滇中茶树种质资源亲缘关系的ISSR分析

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.012.005

吴田^1,,
蓝增全^2, ,,
王华芳^3, ,

1.
西南林业大学园林学院, 云南昆明 650224
2.
西南林业大学环境科学与工程学院, 云南昆明 650224
3.
北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083

基金项目:

中西部高等学校青年骨干教师国内访问学者项目 2016-2017

澜沧江流域古茶研究项目 2017

昌宁县茶树资源保护利用项目 2017

详细信息

作者简介:
吴田(1980-), 女, 博士, 副教授, 研究方向:植物分子生物学(E-mail:461257271@qq.com)

通讯作者:
蓝增全(1963-), 男, 教授, 研究方向:茶学(E-mail:2351417655@qq.com)

王华芳(1956-), 男, 教授, 研究方向:植物生物技术(E-mail:2951175149@qq.com)

中图分类号: S571
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出版历程
- 收稿日期: 2017-01-17
- 修回日期: 2017-10-18
- 刊出日期: 2017-12-28

ISSR-based Genetic Analysis on Relationship of Teas in Central Yunnan

WU Tian^1
,,
LAN Zeng-quan^{2
, ,},
WANG Hua-fang^{3
, ,}

1.
College of Horticulture and Gardening, Southwest Forestry University, Kunming, Yunnan 650224, China
2.
College of Environment Science and Engineering, Southwest Forestry University, Kunming, Yunnan 650224, China
3.
College of Biological Science and Technology, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China

摘要

摘要: 采用ISSR技术对滇中不同地区17份有代表性的茶样的亲缘关系进行研究。随机选择28条ISSR引物进行筛选, 获得15条能产生清晰条带的引物。将这些引物分别进行ISSR-PCR扩增, 共获得稳定且清晰的谱带112条, 多态性谱带103条, 多态性比率为91.96%, 平均每条引物扩增出7.4条谱带。17份滇中茶样的遗传相似系数变化范围为0.58-0.80, 聚为两类, 第Ⅰ类包含12份种质, 第Ⅱ类包含5份种质。
- 宝洪茶 /
- 十里香茶 /
- ISSR /
- 亲缘关系
Abstract: The genetic relationship among 17 representative tea cultivars from various regions in central Yunnan was analyzed using ISSR markers.Out of the randomly selected 28 primers in testing DNA polymorphism of the teas, 15 produced distinctive bands and were chosen for amplification.The ISSR-PCR amplified primers showed 112 stable and clearly defined bands.Of which, 103 were polymorphic (a rate of 91.96%) averaging 7.4 bands each.The GS scores on the cultivars ranged from 0.58 to 0.80 with discrete classifications of Group Ⅰ that consisted of 12 germplasms and Group Ⅱ that composed of the remaining 5 germplasms.
- central Yunnan /
- tea cultivars /
- ISSR-PCR /
- genetic relationship

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图 1 17个茶样的DNA电泳结果

Figure 1. Agarose gel electrophoresis of genomic DNA from 17 tea cultivars

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图 2 ISSR引物筛选

注:M为DNA marker, 1为814, 2为823, 3为815, 4为818, 5为824, 6为825, 7为836, 8为840, 9为841, 10为835, 11为826, 12为842, 13为844, 14为845, 15为847, 16为848, 17为846, 18为827, 19为856, 20为858, 21为853, 22为857, 23为850, 24为854, 25为855, 26为854, 27为855, 28为866。

Figure 2. Screening of ISSR primers

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图 3 引物841最佳退火温度的确定

注:M为DNA marker, 1为50.0℃, 2为51.2℃, 3为51.7℃, 4为52.6℃, 5为53.6℃, 6为54.5℃, 7为55.5℃, 8为56.4℃, 9为57.4℃, 10为58.2℃, 11为58.8℃, 12为59.0℃。

Figure 3. Determination of optimal annealing temperature for primer 841

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图 4 引物815在17份茶样材料中扩增的电泳

注:M为DNA marker 2000, 1~17为表 1茶样。

Figure 4. Electrophoresis of amplified primer 815 in 17 tea cultivars

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图 5 引物845在17份茶样材料中扩增的电泳

注:M为DNA marker 2000, 1~17为表 1茶样。

Figure 5. Electrophoresis of amplified primer 815 in 17 tea cultivars

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图 6 17个滇中茶样的UPGMA聚类

Figure 6. UPGMA-derived dendrogram on 17 tea cultivars

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表 1 供试茶样信息

Table 1. Information on tea cultivars under study

编号	种质资源名称	取样地	叶片颜色	叶面积/cm²	叶柄长度/cm	叶脉数/对
1	楚雄-双柏	楚雄州双柏县鄂嘉镇	绿色	15.3	0.4	7.4
2	玉溪-者竜	玉溪市新平县者竜乡	深绿	14.2	0.5	7.3
3	楚雄-新房子村	楚雄州双柏县爱尼山乡	绿	24.6	0.5	10
4	玉溪-原古	玉溪市元江县羊岔街乡	深绿	32.9	0.7	7.1
5	玉溪-双江	玉溪市峨山县双江镇	绿色	31.1	0.7	10.2
6	玉溪-羊街	玉溪市元江县羊街乡	深绿	24.3	0.6	8
7	昆明-十里香2号	昆明市云南农业大学茶园	深绿	34.2	0.3	12.8
8	昆明-农大小叶种	昆明市云南农业大学茶园	深绿	23.7	0.3	11.8
9	昆明-农大大叶种	昆明市云南农业大学茶园	深绿	44.5	0.4	11.5
10	昆明-宝洪3号	昆明市宜良县匡远镇	深绿	35.3	0.4	8.1
11	昆明-宝洪1号	昆明市宜良县匡远镇	绿色	38.8	0.4	11.2
12	昆明-十里香1号	昆明市云南农业大学茶园	深绿	29.7	0.2	12.3
13	玉溪-界碑村	玉溪市新平县者竜乡	绿色	26.8	0.5	9.8
14	大理-罗伯克	大理州南涧县公郎镇	绿色	41.1	0.4	8.2
15	昆明-宝洪2号	昆明市宜良县匡远镇	绿色	39.3	0.4	9.1
16	楚雄-兔街	楚雄州南华县兔街镇	绿色	21.7	0.5	7.3
17	大理-大栗树	大理州云龙县宝丰乡	绿色	40.2	0.5	8.2

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表 2 引物最佳退火温度探索结果信息

Table 2. Search results on optimal annealing temperature for primers

引物	序列(5′~3′)	最佳退火温度/℃
815	CTCTCTCTCTCTCTCTG	55.0
818	CACACACACACACACAG	52.6
824	TCTCTCTCTCTCTCTCG	53.0
835	AGAGAGAGAGAGAGAGYC	53.0
836	AGAGAGAGAGAGAGAGYA	54.0
840	GAGAGAGAGAGAGAGAYT	58.0
841	GAGAGAGAGAGAGAGAYC	53.6
842	GAGAGAGAGAGAGAGAYG	56.0
844	CTCTCTCTCTCTCTCTRC	56.8
845	CTC TCTCTCTCTCTCTRG	58.0
847	CACACACACACACACARC	56.0
854	TCTCTCTCTCTCTCTCRG	56.6
855	ACACACACACACACACYT	58.8
857	ACACACACACACACACYG	55.0
866	CTCCTCCTCCTCCTCCTC	58.0

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参考文献(19)

[1]	陈兴琰.茶树原产地—云南[M].昆明:云南人民出版社, 1994:30-38.
[2]	沈培平.走进茶树王国[J].普洱, 2008, (4):52-52.
[3]	马建强, 姚明哲, 陈亮.茶树种质资源研究进展[J].茶叶科学, 2015, 35(1):11-16. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/cykx2015010004
[4]	吴华玲, 李崇兴, 陈栋, 等.基于形态鉴定及叶片解剖结构对云南白莺山古茶树资源的聚类分析[J].中国农学通报, 2014, 30(31):114-121. http://www.doc88.com/p-6971896672209.html
[5]	杨洋, 何春阳, 李晓兵.基于GIS的云南栽培型普洱茶树大规模种植适宜性评价[J].北京林业大学学报, 2010, 32(3):33-40. http://www.docin.com/p-700958833.html
[6]	季鹏章, 汪云刚, 蒋会兵, 等.云南大理茶资源遗传多样性的AFLP分析[J].茶叶科学, 2009, 29(5):157-165. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/cykx200905001
[7]	季鹏章, 汪云刚, 张俊, 等.茶组植物亲缘关系的ISSR分析[J].西南农业学报, 2009, 22(3):584-588. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/xnnyxb200903012
[8]	陈亮, 王平盛.应用RAPD分子标记鉴定野生茶树种质资源研究[J].中国农业科学, 2002, 35(10):1186-1191. doi: 10.3321/j.issn:0578-1752.2002.10.004
[9]	LIU B Y, LI Y Y, TANG Y C, et al.Assessment of genetic diversity and relationship of tea germplasm in Yunnan as revealed by ISSR markers[J].Acta Agronomica Sinica, 2010, 36(3):391-400. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1875278009600377
[10]	刘本英, 王丽鸳, 李友勇, 等.ISSR标记鉴别云南茶树种质资源的研究[J].茶叶科学, 2009, 29(5):355-364. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/cykx200905005
[11]	刘本英, 王平盛, 季鹏章, 等.云南特有茶组植物遗传多样性的ISSR研究[J].云南农业大学学报, 2008, 23(3):302-308. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/xnnyxb200903012
[12]	刘本英, 王丽鸳, 周健, 等.云南大叶种茶树种质资源ISSR指纹图谱构建及遗传多样性分析[J].植物遗传资源学报, 2008, 9(4):458-464. https://www.wenkuxiazai.com/doc/a423fd0103d8ce2f006623a8.html
[13]	刘本英, 李友勇, 唐一春, 等.云南茶树资源遗传多样性与亲缘关系的ISSR分析[J].作物学报, 2010, 36(3):391-400. https://www.wenkuxiazai.com/doc/3477830d52ea551810a68768-2.html
[14]	YAO M Z, MA C L, QIAO T T, et al.Diversity distribution and population structure of tea germplasms in China revealed by EST-SSR markers[J].Tree Genetics and Genomes, 2011, 8(1):205-220. doi: 10.1007/s11295-011-0433-z.pdf
[15]	王健胜, 侯桂玲, 程立平, 等.19份苜蓿种质遗传多样性的ISSR分析[J].福建农业学报, 2016, 31(7):708-713. http://www.fjnyxb.cn/CN/abstract/abstract2965.shtml
[16]	郑永军.张芳赐复活"十里香"[J].普洱, 2011, (3):56-59. http://mall.cnki.net/magazine/Article/PUER201103020.htm
[17]	沈晓进.昆明十里香古茶树保护与利用的探讨[J].西南林学院学报, 2004, 24(2):27-29. http://d.old.wanfangdata.com.cn/Periodical/xnlxyxb200402008
[18]	籍媞.昆明宝洪茶[J].茶:健康天地, 2011, (11):13.
[19]	沈雪梅, 沈晓进.宝洪茶在昆明茶产业中的地位及发展探讨[J].云南农业科技, 2008, (3):62-64. doi: 10.3969/j.issn.1000-0488.2008.03.034