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利用ISSR标记分析36份番石榴种质资源的亲缘关系

宁琳 陈豪军 何江 杨祥燕 严霖 唐玉娟

宁琳, 陈豪军, 何江, 杨祥燕, 严霖, 唐玉娟. 利用ISSR标记分析36份番石榴种质资源的亲缘关系[J]. 福建农业学报, 2017, 32(2): 138-143. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.007
引用本文: 宁琳, 陈豪军, 何江, 杨祥燕, 严霖, 唐玉娟. 利用ISSR标记分析36份番石榴种质资源的亲缘关系[J]. 福建农业学报, 2017, 32(2): 138-143. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.007
NING Lin, CHEN Hao-jun, HE Jiang, YANG Xiang-yan, YAN Lin, TANG Yu-juan. Genetic Relationship among Guava Germplasms Accessed by Using ISSR Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2017, 32(2): 138-143. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.007
Citation: NING Lin, CHEN Hao-jun, HE Jiang, YANG Xiang-yan, YAN Lin, TANG Yu-juan. Genetic Relationship among Guava Germplasms Accessed by Using ISSR Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2017, 32(2): 138-143. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.007

利用ISSR标记分析36份番石榴种质资源的亲缘关系

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.007
基金项目: 

农业部热带作物种质资源保护项目 16RZZY-25

广西壮族自治区亚热带作物研究所基本科研业务费专项项目 桂热研201509

详细信息
    作者简介:

    宁琳 (1987-), 女, 助理研究员, 硕士, 从事番石榴种质资源收集保护与种质鉴定工作 (E-mail:87399317@qq.com)

    通讯作者:

    陈豪军 (1966-), 男, 高级农艺师, 主要从事果树资源与栽培研究 (E-mail:haojunc2005@163.com)

  • 中图分类号: S666

Genetic Relationship among Guava Germplasms Accessed by Using ISSR Markers

  • 摘要: 采用ISSR分子标记技术对36份番石榴种质资源的亲缘关系进行分析,PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳后,通过非加权配对算术平均法(UPGMA)进行数据分析,建立种质资源间的亲缘关系;从100条ISSR引物中筛选出9条多态性较丰富且稳定的引物,共扩增出165条带,其中多态性条带129条,多态性百分率为78.18%;扩增结果可将36份种质资源较好地区分开,各种质间遗传相似系数为0.70~0.93,平均遗传相似系数为0.815;在遗传相似系数0.75处,可将36份种质资源分成4组,与形态分类结果大致相符合。结果表明所收集的番石榴种质资源遗传基础较狭窄,但ISSR分子标记技术能较好地鉴别这些种质资源。
  • 图  1  引物UBC890扩增结果

    注:M为DL2000 Maker;1~36为种质资源编号,同表 1

    Figure  1.  Amplified UBC890 primer

    图  2  番石榴种质资源的UPGMA聚类

    注:1~36为资源编号同表 1;A、B、C、D分别对应为聚类分析中的第1组、第2组、第3组、第4组。

    Figure  2.  UPGMA dendrogram of guava germplasms

    表  1  供试资源及取样地点

    Table  1.   Sources of germplasms and sampling sites

    编号 资源名称 取样地点
    1 龙州1号 广西壮族自治区亚热带作物研究所番石榴种质资源圃
    2 龙州2号
    3 龙州3号
    4 长果新世纪番石榴
    5 圆果新世纪番石榴
    6 新世纪实生番石榴
    7 新西兰番石榴
    8 嘉缘番石榴
    9 珍珠番石榴
    10 梨形番石榴
    11 东兴农家种番石榴
    12 汕红番石榴
    13 老虎岭番石榴
    14 琼番石榴17号
    15 泰国大果番石榴
    16 全红番石榴
    17 维邦1号
    18 维邦2号
    19 维邦3号
    20 景洪1号 云南省西双版纳热作所资源圃
    21 景洪2号
    22 河口1号 云南省红河热带农业科学研究所
    23 河口2号
    24 小平田1号 云南省保山市隆阳区热经所
    25 小平田2号
    26 南宁本地番石榴1号 广西壮族自治区亚热带作物研究所番石榴种质资源圃
    27 南宁本地番石榴3号
    28 南宁本地番石榴6号
    29 南宁本地番石榴7号
    30 南宁本地番石榴9号
    31 南宁本地番石榴10号
    32 迷你番石榴
    33 南宁本地番石榴实生1号
    34 南宁本地番石榴实生2号
    35 八桂田园番石榴
    36 南宁本地番石榴8号
    注:供试种质名称为收集种质时所采用的品种名,品种名不明确的,以收集地或植株果实特征命名。所有供试种质通过嫁接现均保存于广西壮族自治区亚热带作物研究所番石榴种质资源圃内。
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    表  2  ISSR引物序列及其扩增结果

    Table  2.   ISSR primer sequence and amplification

    引物编号 引物序列 总条带数/条 多态性条带/条 多态性带比例/%
    UBC810 gagagagagagagagat 15 13 86.67
    UBC811 gagagagagagagagac 22 19 86.36
    UBC812 gagagagagagagagaa 20 16 80
    UBC841 gagagagagagagagayc 20 12 60
    UBC842 gagagagagagagagayg 16 9 56.25
    UBC857 acacacacacacacacyg 13 13 100
    UBC861 accaccaccaccaccacc 14 9 64.29
    UBC889 dbdacacacacacacac 17 12 70.59
    UBC890 vhvgtgtgtgtgtgtgt 28 26 92.86
    合计 165 129 78.18
    下载: 导出CSV
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出版历程
  • 收稿日期:  2016-07-26
  • 修回日期:  2016-10-08
  • 刊出日期:  2017-02-01

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