辣椒EST-SSRs标记的通用性研究

李永平; 陈敏氡; 康建坂; 温庆放

doi:10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.007

辣椒EST-SSRs标记的通用性研究

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.07.007

李永平^{1, 2,},
陈敏氡^{1, 2},
康建坂^{1, 2},
温庆放^{1, 2, ,}

1.
福建省农业科学院蔬菜研究中心, 福建福州 350013
2.
福建省农业科学院作物研究所, 福建福州 350013

基金项目:

福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项 2015R1026-9

国家特色蔬菜产业技术体系 CARS-24-G-07

闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室PI项目 2017

详细信息

作者简介:
李永平(1974-), 女, 副研究员, 研究方向:蔬菜分子育种(E-mail:248937256@qq.com)

通讯作者:
温庆放(1965-), 男, 研究员, 研究方向:蔬菜育种(E-mail:fjvrc@163.com)

中图分类号: S641.3
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出版历程
- 收稿日期: 2017-03-31
- 修回日期: 2017-06-06
- 刊出日期: 2017-07-01

Cross-species Applicability of EST-SSRs from Capsicum annuum L.

LI Yong-ping^{1, 2
,},
CHEN Min-dong^{1, 2},
KANG Jian-ban^{1, 2},
WEN Qing-fan^{1, 2
, ,}

1.
Vegetable Research Center, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, Fujian 350013, China
2.
Crops Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, Fujian 350013, China

摘要

摘要: 为研究辣椒EST-SSRs标记在主要茄科蔬菜间的通用性，从NCBI数据库下载118 900条辣椒相关EST，对其进行SSR位点搜索，用含SSR位点的辣椒ESTs设计的200对EST-SSRs引物对17份辣椒材料、24份番茄材料、16份茄子材料进行PCR扩增，有效扩增比率分别为98%、94.5%、90.5%，多态性比率分别为35.5%、29.5%、26.5%。多态性引物对辣椒、番茄、茄子的特定亲本及其杂种一代F1的亲缘关系进行检测，均能达到预期效果，试验结果说明从辣椒相关EST数据库中开发的SSR引物在茄科植物中有较好的通用性。
- 辣椒 /
- 茄科 /
- EST-SSR /
- 通用性
Abstract: The applicability of the EST-SSRs marker identified on Capsicum annuum L for uses on other solanaceae vegetables was investigated. A total of 118, 900 ESTs in C. annuum L were downloaded from NCBI. Two hundred pairs of EST-SSR primers were developed. Approximately 98%, 94.5% and 90.5% of them were successfully amplified in C. annuum L., Solanum lycopersicum and S. melongena L., respectively, with the polymorphism proportions of 35.5%, 29.5% and 26.5%, respectively. The polymorphic primers specific to the parents and their F1 of C. annuum L., S. lycopersicum and S. melongena L. were tested with the anticipated results. It appeared that the SSR primers developed from the EST database related to C. annuum L. could be applied on solanaceae plants with satisfaction.
- Capsicum annuum L. /
- solanaceae /
- EST-SSR /
- transferability

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图 1 CF063对17份辣椒种质基因组DNA的扩增结果

注：M为marker；1~17为辣椒材料。图 2同。

Figure 1. Amplified products using primer CF063

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图 2 CF179对17份辣椒资源基因组DNA的扩增结果

Figure 2. Amplified products using primer CF179

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图 3 引物CF015、CF043、CF032、CF103和CF56、CF106对亲本及其F1中的扩增结果

注：A为共显性，B为偏父性，C为偏母性。图 6、9同。

Figure 3. Codominant products of primer CF015, CF043, CF032, CF103, CF56 and CF106

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图 6 引物CF007、CF048、CF147对茄子亲本及其F1的扩增结果

Figure 6. Codominant products of primer CF007, CF048 and CF147

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图 9 引物CF035、CF119、CF186、对茄子亲本及其F1中的扩增结果

Figure 9. Codominant products of primer CF035, CF119 and CF185

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图 4 17份辣椒材料的聚类结果

Figure 4. Dendrogram of 17 C. annuum L

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图 5 CF188对16份茄子资源基因组DNA的扩增结果

注：M为marker；1~16为辣椒材料。

Figure 5. Amplified products using primer CF188

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图 7 16份茄子资源聚类

Figure 7. Dendrogram of 16 S. melongena L.

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图 8 CF144对24份番茄资源基因组DNA的扩增结果

注：M为marker；1~24为番茄品种。

Figure 8. Amplified products using primer CF144

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图 10 24份番茄资源的聚类

Figure 10. Dendrogram of 24 S. lycopersicum

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表 1 材料及特定亲本和后代

Table 1. Germplasms, specific parents and offspring used

	编号	基本性状
辣椒材料	PA001、PA002、PA003、PA004	黄椒
	PA005、PA008	朝天椒
	PA009	羊角椒
	PA006、PA010、PA011、PA012、PA013、PA014、PA015、PA016、PA017	牛角椒
	PA007	野生辣椒
	P181-2-6(母)、P230-2-5(父)、T2(F1)
番茄材料	AVT00901、AVT00902、AVT00903、AVT00904、AVT00905、AVT00906、AVT00907、AVT00908、AVT00909、AVT00910、AVT00911、AVT009012、AVT00913	高圆红色大果
	AVT00914、AVT00915	高圆粉色大果
	AVT00917、AVT00918、AVT00919、AVT00920、AVT009121	扁圆形红色大果
	AVT00916、AVT00922	扁圆形粉色大果
	AVT00923	红色小果
	AVT00924	红色长圆形中果
	T56(母)、T157(父)、A16(F1)
茄子材料	ep001	白长茄
	ep002、ep004、ep005、ep006、ep008、ep009 ep010、ep011、ep012、ep013、ep014、ep015	紫长茄
	ep003	绿长茄
	ep007	紫圆茄
	ep0016	紫线茄
	E008(母)、E23(父)、H42(F1)

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