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福建省草莓主栽与引进品种的SSR分子标记鉴定

陈坚 郑益平 郭文杰 杨志敏 庄志鸿 朱炳耀

陈坚, 郑益平, 郭文杰, 杨志敏, 庄志鸿, 朱炳耀. 福建省草莓主栽与引进品种的SSR分子标记鉴定[J]. 福建农业学报, 2018, 33(2): 150-153. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.008
引用本文: 陈坚, 郑益平, 郭文杰, 杨志敏, 庄志鸿, 朱炳耀. 福建省草莓主栽与引进品种的SSR分子标记鉴定[J]. 福建农业学报, 2018, 33(2): 150-153. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.008
CHEN Jian, ZHENG Yi-ping, GUO Wen-jie, YANG Zhi-min, ZHUANG Zhi-hong, ZHU Bing-yao. Identification of Major and Introduced Strawberry Cultivars in Fujian Using SSR Molecular Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2018, 33(2): 150-153. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.008
Citation: CHEN Jian, ZHENG Yi-ping, GUO Wen-jie, YANG Zhi-min, ZHUANG Zhi-hong, ZHU Bing-yao. Identification of Major and Introduced Strawberry Cultivars in Fujian Using SSR Molecular Markers[J]. Fujian Journal of Agricultural Sciences, 2018, 33(2): 150-153. doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.008

福建省草莓主栽与引进品种的SSR分子标记鉴定

doi: 10.19303/j.issn.1008-0384.2018.02.008
基金项目: 

福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项 2015R1019-7

详细信息
    作者简介:

    陈坚(1965-), 男, 研究员, 主要从事植物生化与分子生物学研究(E-mail:chenjian3@hotmail.com)

    通讯作者:

    朱炳耀(1962-), 男, 副研究员, 主要从事资源收集与利用研究(E-mail:251112023@qq.com)

  • 中图分类号: S668.4

Identification of Major and Introduced Strawberry Cultivars in Fujian Using SSR Molecular Markers

  • 摘要: 以在福建省主栽和福建省农业科学院生物技术研究所(本项目组)近年来引进的11个草莓品种为试材,利用SSR分子标记进行分子水平的遗传多样性鉴定。通过建立遗传树状图,以揭示品种之间的亲缘关系。结果表明:10个SSR引物共扩增出109条DNA谱带,其中多态性谱带占91条,多态性比率为83.5%。供试草莓品种的遗传相似系数在0.62~0.89。如果在相似系数0.62处划分,可以明显看出福建省的草莓品种分为2个聚类群,一个类群品种为福莓、红颜、红宝和章姬,均为我国境内引进的品种,其中红宝为本项目组首次从贵州引进;另一个类群基本为美洲引进的栽培原种,包括法兰第、甜查理、阿尔比等传统主栽品种以及本项目组近年从美国引种的紫莓1号、3号新品种,还有1株从北京引进的太空诱变新品种,推测亲本也为美洲系原种。SSR分子标记的分类结果与草莓的地理分布有一定的相关性,筛选的SSR引物明显鉴别出近年来本项目组引进的4个草莓新品种。
  • 图  1  引物02H04(左图)与03B05(右图)在11个草莓供试品种材料中的扩增图谱

    Figure  1.  Amplified profiles of primer 02H04 (photo on the left) and 03B05 (photo on the right) from 11 tested strawberry samples

    图  2  11个草莓样品SSR分子标记聚类

    Figure  2.  Dendrogram of 11 strawberry cultivars based on SSR molecular markers

    表  1  供试材料

    Table  1.   Materials testeds

    编码 品种名称 来源
    F 法拉第 美国引进
    T 太空2号 本项目北京引进
    TC1 甜查里1 美国引进
    TC2 甜查里2 本项目单株选育
    Z1 紫莓1号 本项目美国引进
    Z3 紫莓3号 本项目美国引进
    A 阿尔比 美国引进
    Fm 福莓 本省选育
    H 红宝 贵州引进
    Hy 红颜 浙江引进
    Zj 章姬 浙江引进
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    表  2  引物及其扩增结果统计

    Table  2.   Summary of amplified SSR primers

    引物编号 引物序列 扩增总带数 多态性的带数 多态性占比/%
    01H05 F:GGGAGCTTGCTAGCTAGATTTG;R:AGATCCAAGTGTGGAAGATGCT 10 8 80
    02C07 F:CTCTCCCCACAAAACCCTAAAC;R:AAAGATCGGTAGGCACAGAGAG 13 13 100
    02F07 F:GAGGCTTACCGTTCCAATCTTC;R:GTTGGGATCCTCTAACATCTGG 7 6 85.7
    02G01 F:ACGAGGTGGGTTTTGTGTTGT;R:CCCAGATGAAGAAACCGATCTA 13 12 92.3
    02H04 F:ATCAGTCATCCTGCTAGGCACT;R:TACTCTGGAACACGCAAGAGAA 13 10 76.9
    03B05 F:GGAATCCAAGTTACAGGCTTCA;R:AAGGAGCCTCTCCAATAGCTTC 12 8 66.7
    03D11 F:GCCTTGATGTCTCGTTGAGTAG;R:TACCTTCTGCATTCACCATGAC 18 14 77.8
    04G04 F:ACGAGGCCTTGTCTTCTTTGTA;R:GCTCCAGCTTTATTGTCTTGCT 3 3 100
    08C11 F:GGACGTCCCCTTCTTTATTTCT;R:ACCCCACATTCCATACCACTAC 14 11 78.6
    08H09 F:CTTCACCTAATCACTTGCCTGA;R:GGTCTGTTCCTTTCCTTGTTTG 6 6 100
    总计 109 91 83.5
    下载: 导出CSV
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出版历程
  • 收稿日期:  2017-09-14
  • 修回日期:  2017-12-01
  • 刊出日期:  2018-02-01

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